葡聚糖凝膠是經羥丙基化處理后得到的產物，不僅可在水中應用，也可在極性有機溶劑或他們與水組成的混合溶劑中膨潤使用，適合中藥有效成分的分離純化以及抗生素和化學藥物的精細純化。

　　葡聚糖凝膠的分離原理主要有兩方面：以凝膠過濾作用為主，兼具反相分配的作用（在反相溶劑中）。因為凝膠過濾作用，所以大分子的化合物保留弱，先被洗脫下來，小分子的化合物保留強，最后出柱。如果使用反相溶劑洗脫，葡聚糖凝膠對化合物還起反相分配的作用，所以極性大的化合物保留弱，先被洗脫下來，極性小的化合物保留強，后出柱。如果使用正相溶劑洗脫，這主要靠凝膠過濾作用來分離。

　　葡聚糖凝膠常選用單一的溶劑系統，應用最多的是極性強弱不同的如下五種：水、甲醇、丙酮、乙酸乙酯、二氯甲烷。根據溶劑極性的不同，樣品分別發生正相或反相分配作用。

　　除水以外，甲醇是多年來一直使用的極性*的流動相。當甲醇作為流動相時，葡聚糖凝膠的保留行為：芳香族化合物＞脂環族化合物＞脂肪族化合物。甲醇作為流動相的另一個特點是：對不同芳香族化合物可選擇性保留，這取決于苯環上存在的官能團及雜原子性質、數目和位置。苯環上存在的官能團及雜原子減弱了苯環本身的性質。苯環上所帶的OH-越多，極性越強，在葡聚糖凝膠上滯留的時間越長。堿性物質比酸性或中性物質在葡聚糖凝膠上滯留的時間更長。